功能性消化不良分為三個亞型，下面詳細分析：

1、潰瘍樣消化不良：它是以消化性潰瘍的癥狀為特征而無潰瘍的存在。

2、動力障礙樣消化不良：胃排空延緩癥狀為主。

3、反流型消化不良：以反酸、胃灼熱、胸骨后疼痛為主要癥狀，反流性癥狀主要由胃食管反流所致，與胃食管反流病鑒別點主要根據(jù)是否伴有上腹部癥狀，胃鏡檢查無食管炎。

4、非特異型消化不良：癥狀不能歸于上述各型者。不少患者同時具有以上兩種或兩種以上類型的癥狀，稱之混合型。