內(nèi)異癥主要臨床表現(xiàn)為痛經(jīng)，疼痛多位于下腹部及腰骶部，可放射至陰道、會陰、肛門或大腿，并伴有性交痛，漸進性痛經(jīng)是本病的特點。

內(nèi)異癥另外一個特點是月經(jīng)不調(diào)，表現(xiàn)為經(jīng)量增多或經(jīng)期延長，月經(jīng)紫黯有塊，排流不暢，少數(shù)經(jīng)前點滴出血。

子宮內(nèi)膜異位癥主要病理變化為異位種植的子宮內(nèi)膜同在位的子宮內(nèi)膜一樣受卵巢激素支配，發(fā)生周期性出血，血液、分泌液、及組織碎片聚集在組織間 隙內(nèi)，血漿及血紅蛋白緩慢吸收，病灶周圍產(chǎn)生類似感染炎性的反應，纖維組織增生、粘連、皺褶并形成疤痕。在病變處出現(xiàn)紫褐色斑點或小泡，最后形成大小不等的紫藍色結(jié)節(jié)或包塊。病變因發(fā)生部位程度不同而有所差異。

子宮內(nèi)膜異位癥病灶分布較廣，其中宮骶韌帶76%，子宮直腸陷凹79%，卵巢55。2%，還有分布于盆腔各部位和盆腔器官的表面，根據(jù)部位分為腹膜子宮內(nèi)膜異位癥、卵巢子宮內(nèi)膜異位癥等。

在內(nèi)異癥患者中有40%的病人繼發(fā)不孕。婦科檢查時子宮多后傾固定，直腸子宮陷凹等部位可捫及觸痛性結(jié)節(jié)。通過超聲檢查（B超）可發(fā)現(xiàn)卵巢巧克力囊腫。