內異癥患者不孕率高達40%，而在不孕癥患者中，約80%有異位癥，其中20%患者有中度以上病變。不孕的原因復雜，子宮內膜異位癥引起不孕的原因主要為：免疫功能異常、盆腹腔內微環(huán)境改變、盆腔解剖結構異常、卵巢功能異常、自然流產率增加等。

1、免疫功能異常

異位的內膜被體內免疫系統(tǒng)識別為“異物”，激活體內免疫系統(tǒng)，產生抗原抗體反應，激活補體系統(tǒng)，細胞因子增多。多種細胞因子和補體系統(tǒng)造成的損傷反應導致不孕；

2、盆腹腔內微環(huán)境改變

內異癥患者腹腔液中含有異常物質可導致不孕；

3、盆腔解剖結構異常

重度內異癥病灶可以導致盆腔局部解剖結構異常，如卵巢、輸卵管周圍廣泛粘連，導致輸卵管梗阻或引起扭曲，使輸卵管蠕動異常，影響拾卵和對受精卵的運輸功能；

4、卵巢功能異常

異位癥患者的排卵障礙發(fā)病率為l7%～27%，可能與腹腔液中PGs升高而影響卵泡發(fā)育和排卵有關；即使有排卵，患者卵泡和黃體細胞上的LH受體量減少，導致黃體分泌不足，黃體形成不良而影響受孕。此外，未破裂卵泡黃素化綜合征在異位癥患者中的發(fā)病率高達18%～79%，也是不孕的原因；

5、自然流產率增加

異位癥患者妊娠，約40%發(fā)生自然流產，而正常妊娠者自然流產率只有15%。流產的發(fā)生與升高的PG刺激子宮收縮及干擾受精卵著床有關。