1、痛經(jīng)，這是巧克力囊腫的主要癥狀，為繼發(fā)性且逐年加重，但也有少數(shù)病人無明顯的痛經(jīng)。異位的子宮內(nèi)膜受卵巢激素的作用，與正常子宮內(nèi)膜有同樣的周期性變化，月經(jīng)后半期，異位的內(nèi)膜高度增厚充血，子宮內(nèi)膜異位瘤內(nèi)壓力逐漸增加，行經(jīng)時(shí)經(jīng)血聚積囊內(nèi)，使囊壁承受的壓力驟然增加而引起疼痛。因此，子宮內(nèi)膜異位癥痛經(jīng)的特點(diǎn)多從月經(jīng)前甚至周期后半期開始，持續(xù)整個(gè)月經(jīng)期至月經(jīng)后數(shù)日消失。疼痛部位多在下腹正中，或偏于一側(cè)，病變浸及子宮直腸。

2、月經(jīng)不調(diào)，患者主要表現(xiàn)為痛經(jīng)、月經(jīng)量比較多，一般是由于巧克力囊腫導(dǎo)致的卵巢功能發(fā)生紊亂引起的。

3、性生活痛：子宮直腸窩陰道后穹隆，宮骶韌帶等部位的子宮內(nèi)膜異位癥均可發(fā)生性生活痛，而且常于月經(jīng)前較為明顯。

4、不孕，多數(shù)子宮內(nèi)膜異位癥患者伴有不孕癥，在原因不明的不孕癥患者中多數(shù)伴有子宮內(nèi)膜異位癥，患者常因盆腔器官粘連，使輸卵管蠕動(dòng)受阻或輸卵管堵塞等機(jī)械因素導(dǎo)致不孕，亦可能為卵巢功能不全，自身免疫反映增強(qiáng)，前列腺素增加，泌乳素增高等因素有關(guān)。

5、腹膜炎，卵巢子宮內(nèi)膜囊腫，囊壁較脆缺乏彈性，經(jīng)血逐漸聚積，囊內(nèi)壓力不斷增高，內(nèi)容物可自囊壁的薄弱部位潰破，溢入腹腔刺激腹膜，引起腹膜炎，出現(xiàn)急腹癥。