第一種可能是，巧克力囊腫的診斷還不明確。巧克力囊腫診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”是通過腹腔鏡手術(shù)，看到囊腫內(nèi)含有巧克力樣的液體，并在手術(shù)剝離囊腫后進(jìn)行病理診斷，如此才能100%確診。一般的B超診斷，只能做一個大概的評估。因此可能存在把一些生理性囊腫（生理性囊腫會隨著月經(jīng)周期而發(fā)生不同的變化，一般3-6個月會自行消退或縮小，達(dá)到自愈）誤當(dāng)成巧克力囊腫的情況。

第二種可能是，患者的巧克力囊腫本身很?。?-50px），在無意當(dāng)中進(jìn)行了一些治療，比如口服避孕藥?？诜茉兴幹泻懈咝г屑に?，可抑制異位內(nèi)膜的生長，因此，小的巧克力囊腫就可能萎縮掉。

第三種可能是，當(dāng)囊腔內(nèi)積血過多、壓力過高（尤其月經(jīng)前期或剛來月經(jīng)時）、性生活等原因，可能導(dǎo)致囊腫破裂。