1、自身免疫反應(yīng)：子宮內(nèi)膜異位癥患者體內(nèi)的B淋巴細(xì)胞能生成一種抗子宮內(nèi)膜抗體，此抗體能干擾早期受精卵的輸送和著床，而且腹腔內(nèi)由于子宮內(nèi)膜異位癥的存在而導(dǎo)致大量的吞噬細(xì)胞聚集，吞噬精子和干擾受精卵細(xì)胞的分裂，最后造成女性不孕。

2、黃體功能不足：患者卵泡和黃體細(xì)胞上的LH受體數(shù)量比正常女性要明顯的少，使得黃體期黃體分泌的激素不足而對受孕帶來影響。

3、未破裂卵泡黃素化綜合征：很多研究發(fā)現(xiàn)，子宮內(nèi)膜異位癥患者沒有破裂卵泡黃素化的發(fā)病率比正常女性要明顯的高，因此多出現(xiàn)不孕。不過，卵泡細(xì)胞黃素華，患者基礎(chǔ)體溫雙相，子宮內(nèi)膜分泌期改變，不過由于未排卵而沒有受孕的可能。

4、其他原因：部分子宮內(nèi)膜異位癥患者有腹痛腹瀉癥，長時間腹瀉能造成營養(yǎng)不良，也對卵巢的排卵功能帶來影響。子宮內(nèi)膜異位癥患者在性交時會出現(xiàn)性交疼痛，影響患者的情緒，甚至抑制排卵。