肛門上皮與直腸粘膜不同，伸縮性小，大便干燥。排便時容易受刺激、被擦傷。受傷部位90%是在背側（肛門時鐘的六點位上）。肛門受傷后導致出血，出血量較小，但感覺非常疼痛，不僅在排便時感到疼痛，排便后一段時間內也會感到劇痛無比，因此也有些人從此害怕上廁所，控制排便，導致便秘，從而加重肛裂的程度。

早期的肛裂只需要改善日常生活習慣就能治愈，但因為是在排便通道口肛門處受傷所以排便時容易使傷口擴大。傷口也就不容易愈合了，再加上持續(xù)便秘，大便干燥。致使最初很淺的傷口漸漸加深，傷口周圍呈堤防狀以致“潰瘍化”，這被稱做"肛門潰瘍”發(fā)展成肛門潰瘍后，肛門變得越狹窄，導致“肛門狹窄”，肛門變得只有鉛筆粗細般狹窄，造成排便困難。

這時，只有通過手術來擴大肛門。另外，肛門潰瘍致使排便困難，糞便中的細菌侵入傷口，引起感染，發(fā)生炎癥，潰瘍的直腸部分生有息肉（肛門息肉）。潰瘍的肛門部分生成“皮膚痔”或被稱之為“前哨痔”的像小疙瘩似的突起物像這種生成息肉和前哨痔的肛裂也需要通過手術來治療。但肛裂產生的息肉與所謂的大腸息肉性質不同，不會發(fā)生病變。