鹽酸小檗堿又名黃連素，從黃連、黃檗中提煉出來的一種生物堿。它具有顯著的抑菌作用。對痢疾桿菌、大腸桿菌引起的腸道感染有效，用于治療腸道感染、腹瀉。

鹽酸小檗堿能對抗病原微生物，對多種細菌如痢疾桿菌、結核桿菌、肺炎球菌、傷寒桿菌及白喉桿菌等都有抑制作用，其中對痢疾桿菌作用最強，常用來治療細菌性胃腸炎、痢疾等消化道疾病。小檗堿用不同的堿處理，可得到季銨式、醛式和醇式等三種不同形式的小檗堿，其中以季銨式最穩(wěn)定。小檗堿對溶血性鏈球菌、金黃色葡萄球菌、淋球菌和弗氏、志賀氏痢疾桿菌均有抗菌作用，并有增強白血球吞噬作用。用中醫(yī)學解釋，此類藥物性涼，能清除邪熱或虛熱，清除有害毒物，自古以來就是中醫(yī)手中的一味清熱解毒良藥。

臨床主要用于治療細菌性痢疾和腸胃炎，它副作用較小。黃連素口服后，幾乎不被胃腸道吸收，只是停留在腸道，對抗致病的細菌。這一特性雖然使黃連素對胃腸道以外的感染沒有效果，但由于黃連素不被吸收入血液，所以副作用很小?？茖W家曾給小鼠按每千克體重8克的用量服用黃連素，24小時后尚有半數(shù)小鼠存活。如果換作是體重60千克的人，相當于每天吃上接近250克。

黃連素的副作用比較小，但不等于說黃連素沒有副作用，醫(yī)學專家指出，醫(yī)學研究及臨床實踐發(fā)現(xiàn)，黃連素的主要副作用是可使胃酸過多，即中醫(yī)所說“苦敗胃”。同時，黃連素最常見的副作用是便秘，大量應用后偶有惡心、嘔吐、皮疹及發(fā)熱，甚至可能導致橫紋肌溶解癥及乳酸中毒癥。最需要警惕的是，常服黃連素可能會導致B族維生素吸收障礙，從而出現(xiàn)周圍神經(jīng)炎。

除了用于感染性腹瀉外，現(xiàn)代藥理學研究證實黃連素具有顯著的抗心力衰竭、抗心律失常、降低膽固醇、抗制血管平滑肌增殖、改善胰島素抵抗、抗血小板、抗炎等作用，因而在心血管系統(tǒng)和神經(jīng)系統(tǒng)疾病方面將可能有廣泛、重要的應用前景。

黃連素只適用于感染性腹瀉，對輕型炎癥可以選用黃連素，對于重型則必須合用抗感染作用強的抗生素。