人的免疫系統(tǒng)是一個相對穩(wěn)定的系統(tǒng)，其平衡一旦打破，就容易得病。但是不等于說，免疫指標一有異常就是“自身免疫疾病”。

大量的研究表明，口腔潰瘍患者的免疫指標有些是不正常的，但也有一部分人是正常的，因此在給該病“定性”的問題上發(fā)生了分歧。

不少學者認為該病屬于自身免疫性疾病，其根據(jù)有：病情遷延反復，對皮質激素敏感等，有報道約70%-80%的復發(fā)性口腔潰瘍有抗口腔粘膜鹽水組織均漿的自身抗體，而對照組僅10%。

但也有人指出這些抗體對口腔粘膜是非特異性的，而且在復發(fā)性口腔潰瘍患者中均未查見抗核抗體，而作為自身免疫性疾病主要指標之一的抗核抗體，可見于各種自身免疫性疾病，因此該病不能完全確定為自免疫性疾病。正常人體存在著一個極其復雜而精密的免疫調節(jié)系統(tǒng)，包括一些免疫細胞及免疫活性細胞產生的各種因子，它們形成一個復雜的調節(jié)網絡，控制著機體的免疫功能正常進行。

盡管目前還不能把復發(fā)性口腔潰瘍明確地劃歸自身免疫性疾病的“隊伍”，但根據(jù)患者的免疫狀態(tài)進行調節(jié)仍然十分必要。因為一個平衡而穩(wěn)定的免疫系統(tǒng)對于抵抗疾病總是有利的。