陰莖的大小主要是受遺傳因素的影響，真性男性陰莖短小癥是多見于先天性，少數(shù)為后天的。先天癥的有睪丸發(fā)育不全癥又稱克氏綜合癥。這類病人，身材高大而陰莖卻短小，睪丸小，陰莖雖能勃起，且具有性欲、射精和遺精等正常性功能，但由于睪丸不能產(chǎn)生精子，所以排出的精液中無精子，因而無生養(yǎng)能力。

陰莖短小的危害主要就是讓這部分人產(chǎn)生自卑的心理，還有就是在夫妻生活上可能不順心。所以一定要解決心理上的自卑感通過學(xué)習性生活技巧填補生殖器短小之不足或通過手術(shù)進行延長以彌補。

陰莖短小常伴有男性第二性征（陰毛、腋毛和胡須、變聲、喉結(jié)、男性生殖器形態(tài)等）發(fā)育不全或逐漸退化，精神萎靡，全身乏力，缺乏男性的陽剛之氣；陰毛稀少，性欲減退，或出現(xiàn)陽痿、早泄等性功能障礙的毛病。