生殖器皰疹是由單純皰疹病毒（HSV）Ⅱ型所引起的一種性傳播疾病。單純皰疹病毒有兩型，I型皰疹病毒的感染主要發(fā)生在口鼻周圍，在高燒后口周長的水皰（俗稱熱皰）就屬于這一類。Ⅱ型皰疹病毒感染則大多發(fā)生在肛門、生殖器周圍，主要通過性接觸傳播。

目前一般認為生殖器皰疹是一種復發(fā)性的終生性疾病，由于單純皰疹病毒在感染生殖器皮膚黏膜后，可感染感覺或自主神經(jīng)末梢，潛伏在骶神經(jīng)節(jié)形成潛伏感染，潛伏的病毒受一些因素影響而復活，導致皰疹復發(fā)。

生殖器皰疹患者、亞臨床或無癥狀排毒者及不典型生殖器皰疹患者都是傳染源，有水皰期的傳染性極強，單純皰疹病毒感染往往是全身性的，可存在于皮損、滲液、精液、前列腺液、宮頸及陰道的分泌物中，主要通過性接觸傳播。

有研究表明臨床發(fā)作與無癥狀感染者的分泌物中均發(fā)現(xiàn)皰疹病毒，而且在疾病的無癥狀期，病毒的出現(xiàn)機率是相同的，潛在傳染性也是一樣的。因此，生殖器皰疹皮損完全消退后還有傳染性，只不過傳染性相對減弱了。