生殖器皰疹病毒極具偽裝性，誤導(dǎo)機(jī)體防御功能。藥效的發(fā)揮先要使得藥物的有效成分進(jìn)入血液，再隨血液循環(huán)進(jìn)入到組織細(xì)胞液中。再根據(jù)病毒的特征進(jìn)行識(shí)辨并與其結(jié)合殺滅吞噬。臨床表明病毒變異后可進(jìn)行偽裝，讓機(jī)體無法識(shí)別，或釋放假信號(hào)避免藥物和免疫系統(tǒng)的殺滅，即使治愈也可能是暫時(shí)性的一種假象，很容易再次復(fù)發(fā)。

生殖器皰疹病毒本身就很難殺滅，如果不規(guī)范用藥和治療，不但收不到效果，還會(huì)加劇病毒耐藥性，給病毒在體內(nèi)的依附和復(fù)制提供可趁之機(jī)，藥物對病毒的殺滅作用遠(yuǎn)比不上病毒復(fù)制，使得病毒不斷復(fù)制變異、種群多樣化和復(fù)雜化。同時(shí)抗生素濫用影響機(jī)體的免疫機(jī)能，制約和影響著生殖器皰疹的治療過程，使得病情反復(fù)難愈。

皰疹病毒特殊附著性，傳統(tǒng)治療很難解除。生殖器皰疹的致病病毒（Ⅱ型單純皰疹病毒）潛伏于神經(jīng)節(jié)內(nèi)，麻痹機(jī)體免疫調(diào)節(jié)機(jī)能，在機(jī)體各項(xiàng)免疫機(jī)能正常時(shí)時(shí)蟄伏待機(jī)，當(dāng)機(jī)體調(diào)節(jié)機(jī)能紊亂、免疫功能低下時(shí)，病毒迅速激活，危害組織器官，在治療上藥物很難從神經(jīng)節(jié)內(nèi)清理生殖器皰疹病毒，治療的同時(shí)對自身的損傷也較大。