陰莖上起痘痘且很疼，可能是由毛囊炎、皮脂腺囊腫感染、生殖器皰疹、尖銳濕疣、陰莖癌等原因引起。

1. 毛囊炎：陰莖部位的毛囊受到細菌感染，引發(fā)炎癥，形成紅腫疼痛的痘痘。這通常是由于局部衛(wèi)生不佳、摩擦刺激等導致。治療上，可外用莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏等，嚴重時需口服抗生素，如頭孢呋辛酯片。

2. 皮脂腺囊腫感染：皮脂腺分泌的皮脂排出受阻，形成囊腫，當合并感染時會出現(xiàn)疼痛和紅腫。一般需要先控制感染，可使用碘伏消毒，外用紅霉素軟膏等，感染控制后，必要時可行手術切除。

3. 生殖器皰疹：由單純皰疹病毒感染引起，表現(xiàn)為簇集或散在的小水皰，破潰后形成潰瘍、糜爛，伴有疼痛。治療以抗病毒為主，常用藥物有阿昔洛韋片、伐昔洛韋片等。

4. 尖銳濕疣：人乳頭瘤病毒感染所致，初起為細小淡紅色丘疹，逐漸增大增多，表面凹凸不平。治療方法包括藥物治療（如鬼臼毒素酊）、物理治療（如激光、冷凍）等。

5. 陰莖癌：較為少見，早期表現(xiàn)為丘疹、疣狀紅斑或經(jīng)久不愈的潰瘍，隨著病情進展，可出現(xiàn)疼痛。治療多采用手術切除，結(jié)合放療、化療等。

陰莖上起痘痘且疼痛的原因較為復雜，需要結(jié)合具體癥狀、病史等進行綜合判斷。如果出現(xiàn)這種情況，應避免自行擠壓或處理，及時到正規(guī)醫(yī)院就診，明確診斷后進行針對性治療。同時，要注意保持陰莖部位的清潔衛(wèi)生，避免不潔性行為。