核磁共振對膽結(jié)石診斷效果較好，但代價較高，不是所有膽結(jié)石患者都需要作此檢查。

對于膽囊結(jié)石患者而言，B超檢查已經(jīng)基本上能夠滿意的提供制定治療方案的影象學資料。而對于膽管結(jié)石患者來說，如何提供整個膽道的連續(xù)的、完整的圖象是至關重要的，這樣的資料才能夠反映膽管結(jié)石的部位、結(jié)石的數(shù)目、大小以及結(jié)石的分布情況，這些是醫(yī)生制定治療方案的關鍵。在這個問題上，內(nèi)鏡逆行胰膽管造影與經(jīng)皮肝穿刺膽管造影比核磁共振和CT更有優(yōu)勢，因為CT或核磁共振雖然能提供目前技術條件下最為清晰的圖象資料，但這些資料都是間隔一定距離的人體的斷層資料，而非連續(xù)性的膽道的圖象，內(nèi)鏡逆行胰膽管造影與經(jīng)皮肝穿刺膽管造影提供的則是完整而連續(xù)的膽道顯影。對于疑有膽囊或膽管腫瘤的患者來說，CT或核磁共振成象則是必不可少的檢查，它們能較為準確地定性鑒別腫瘤組織與結(jié)石或鈣化斑。