感染幽門螺桿菌后少有自發(fā)清除，因此慢性胃炎常長期持續(xù)存在，但多數(shù)患者無癥狀。少部分慢性淺性胃炎可發(fā)展為慢性多灶萎縮性胃炎，后者常合并腸化生。極少數(shù)慢性多灶萎縮性胃炎經(jīng)長期演變可發(fā)展為胃癌，流行病學(xué)研究顯示，慢性多灶萎縮性胃炎患者發(fā)生胃癌的危險明顯高于普通人群。由幽門螺桿菌感染引起的胃炎約15%～20%會發(fā)生消化性潰瘍，以胃竇炎癥為主者易發(fā)生十二指腸潰瘍，而多灶萎縮者易發(fā)生胃潰瘍，前者極少發(fā)生胃癌，而后者發(fā)展為胃癌的危險性增加。幽門螺桿菌感染引起的慢性胃炎還偶見發(fā)生胃粘膜相關(guān)淋巴組織淋巴瘤者。在不同地區(qū)人群中的不同個體感染幽門螺桿菌的后果如此不同，被認為是細菌、宿主 (遺傳) 和環(huán)境因素三者相互作用的結(jié)果，但對其具體機制至今尚未完全明了。