病毒性心肌炎患者應臥床休息，進易消化和富含維生素和蛋白質的食物。心力衰竭應及時控制，但應用洋地黃類藥時須謹慎，從小劑量開始，擴血管藥和利尿藥也可應用。早搏頻繁，或有快速心律失常者用抗心律失常藥。如因高度房室傳導阻滯、快速室性心律或竇房結損害而引起昏厥或低血壓，則需用電起搏或電復律，多數三度房室傳導阻滯患者借起搏器渡過急性期后得到恢復。

腎上腺皮質激素的應用，可使嚴重心肌炎的心力衰竭好轉，嚴重心律失常（如高度房室傳導阻滯）減輕或消除，其作用可能是通過抑制心肌炎的炎癥和水腫、消除變態(tài)反應、減輕毒素的作用。實驗中激素抑制干擾素的合成和釋放、加速病毒增殖，引起感染加重，故目前認為一般患者不必應用，尤其是發(fā)病最初10天內。但臨床實踐證明，對重癥患者，激素仍宜應用，以渡過危重時期。對經其他方法治療效果不佳者、或免疫反應強烈者，在發(fā)病后10天至1月內，也可考慮應用激素。對一般心肌炎患者，應用激素，環(huán)孢素等作免疫抑制治療未證明有益。

促進心肌代謝的藥物，如三磷酸腺苷、輔酶A、肌苷、環(huán)化腺苷酸、細胞色素C等在治療中可能有輔助作用，一般可選用三磷酸腺苷10～20mg，或輔酶A50u，或肌苷200～400mg，或環(huán)化腺苷酸20～40mg，或細胞色素C15mg肌肉注射，2～3次/d。近年來輔酶Q10也用于治療心肌炎，口服20～60mg 3次/d。提高免疫功能的藥，近年來發(fā)現(xiàn)黃芪對提高免疫功能及改善心功能有益，口服或注射均可，也可用免疫核糖核酸每周皮注射6mg或胸腺素10mg，每天一次肌注，也可用轉移因子、干擾素治療。

依據心肌損害范圍、部位、嚴重程度、心功能狀態(tài)以及是否及時合理治療而異。多數病例預后良好，經數周或數月可以痊愈。心臟傳導系統(tǒng)受損者可有致命性心律失常。少數重癥暴發(fā)病例可在數小時或數日內死于急性心力衰竭、肺水腫或心源性休克。新生兒病死率可高達75%。部分病例病程遷延達1年以上，臨床癥狀反復出現(xiàn)，X線及心電圖異常久不恢復；或呈進行性心臟增大，反復心力衰竭而發(fā)展為慢性心肌炎。某些病例經長期觀察已無心肌炎表現(xiàn)或心功能改變，但持續(xù)存在穩(wěn)定的心電圖異常如期前收縮、工度房室傳導阻滯、不完全性右束支傳導阻滯等，可能系心肌炎性病灶遺留的纖維化瘢痕所致后遺癥，不能認為是活動期表現(xiàn)。近年有人提出心肌炎可進一步發(fā)展為心內膜彈力纖維增生癥或特發(fā)性心肌病。