腦膜炎治療及時一般不會留下后遺癥，但如果病情重的話也有可能遺留后遺癥。由于病變可引起腦膜粘連和腦實質的損害，因此可以出現顱神經麻痹、失明、聽力障礙、肢體癱瘓、癲癇及智力減退等后遺癥。因此，腦膜炎一定要學會及時的鑒別和治療。一般腦膜炎易和以下疾病混淆。

1、化膿性腦膜炎

其中最易混淆者為嗜血流感桿菌腦膜炎，因其多見于2歲以下小兒，腦脊液細胞數有時不甚高，其次為腦膜炎雙球菌腦膜炎及肺炎雙球菌腦膜炎，鑒別除結核接觸史，結素反應及肺部X線檢查可助診斷外，重要的還是腦脊淮檢查，在細胞數高于外，重要的還是腦脊液檢查，在細胞數高于1000×106/L（1000/mm2），且分類中以中性多形核粒細胞占多數時，自應考慮化膿性腦膜炎；但更重要的是細胞學檢查。

2、病毒性中樞神經系統(tǒng)感染

主要是病毒性腦炎，病毒性腦膜腦炎及病毒性脊髓炎均可與結腦混淆，其中散發(fā)的病毒腦炎比流行性者更需加以鑒別，各種病毒性腦膜炎之診斷要點為：

①常有特定之流行季節(jié)，

②各有其特殊的全身表現，如腸道病毒可伴腹瀉，皮疹或心肌炎

③腦脊液改變除細胞數及分類與結腦不易鑒別外，生化改變則不相同，病毒性腦膜腦炎腦脊液糖及氯化物正?；蛏愿撸鞍自龈卟幻黠@，多低于1g/L（100mg/dl），

④各種病毒性腦炎或腦膜炎有其特異的實驗室診斷方法，如血清學檢查及病毒分離等（參閱各有關專章節(jié)），輕型病毒腦炎和早期結腦鑒別比較困難。

處理原則是：①先用抗結核藥物治療，同時進行各項檢查，如結素試驗，肺X線片等以協(xié)助診斷，②不用激素治療，如短期內腦脊液恢復正常則多為病毒腦炎而非結腦，③鞘內不注射任何藥物，以免引起腦脊液成分改變增加鑒別診斷之困難。

3、新型隱球菌腦膜腦炎

其臨床表現，慢性病程及腦脊液改變可酷似結腦，但病程更長，可伴自發(fā)緩解，慢性進行性顱壓高癥狀比較突出，與腦膜炎其他表現不平等，本病在小鍺較少見故易誤診為結腦，確診靠腦脊液涂片，用墨汁染色黑地映光法可見圓形，具有厚莢膜折光之隱球菌孢子，沙保培養(yǎng)基上有新型隱球菌生長。